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1) 无菌奶保质期达不到1个月的要求，常温下7~10d开始变质。生产工艺、卫生工艺都很好，生产线设计也很完整、正规，只是用了廉价的盘管式超高温灭菌机，影响了产品的保质期，很多中小型乳品厂也选用盘管式超高温灭菌急切都存在类似的问题。盘管式超高温灭菌机虽然结构简单，价格低廉，但控制不稳定，温度不均匀，没有自动控制和自动调节功能，另外管路光洁度不高，又属蒸汽直接对管加热，容易糊管和管壁结垢，杀菌不彻底，因此不适于灭菌奶的生产。
2) 由同一台超高温灭菌机供料，利乐包装机生产的产品质量稳定，保质期长；而国产包装机生产的产品保质期不稳定，其原因是国产包装机安装的管路是该厂自己设计和施工的。不按规范设计造成无菌管路设计不合理，CIP清洗有死角，清洗流速不够，无菌罐改造达不到灭菌温度的要求，管路焊接处焊瘤严重，对奶产生二次污染。
3) 生产线设计配备无菌罐，由于无菌罐耐压不够，无法用蒸气达到121℃的灭菌温度，杀菌不彻底，产品时好时坏。灭菌后的奶，经过一个设备就增加1次污染的机会。这种配套方式虽然对组织生产有利，但灭菌达不到要求，就会造成二次污染。
4) 无菌管路不使用无菌阀。普通阀门虽然结构简单，也便于清洗，但最大缺点是密封性不好，特别是在高温灭菌和降温冷却后，温差变化很大，极易出现渗漏，也是造成二次污染的重要原因。
5) 生产初期质量较稳定，半个月后出现坏包，而且越来越严重。经检查发现灌装嘴内的密封圈和连接螺纹部分清洗不干干净，在缝隙处有奶垢。另外成型器及无菌室内与包装膜相接触的构件有黏着物，对成品产生二次污染。
6) 设计生产线选用磁力泵供料，保质期始终不稳定，坏包率较高。其原因为选择成品件不合适。磁力泵结构特点是转子室间隙狭小，清洗不干净，特别是石墨轴套润滑沟槽处，更不容易清洗彻底，带菌的奶进入某个袋内，该袋就会坏包。
7) 装空压机时未安装空气净化器，从空压机出气口直接与包装机相连。当夏季空气温度大时，大量的水分进入包装机内，在精密过滤器积存大量的冷凝水市区滤菌作用。无菌空气质量保证不了，破坏了无菌环境造成二次污染。
8) 试生产阶段，坏包率逐渐增加，最后达到100%.对无菌管路和包装机全面检查也未发现异常。最后拆开板式超高温灭菌机，发现加热段和冷却段叶片结垢严重，由于CIP清洗不及时及不彻底，出现的奶垢对奶二次污染。
9) 板式超高温灭菌机与2台无菌包装机直联，由一个管路供料，首台包装机的产品合格而后一台包装机的产品坏包率明显增加，只在37℃恒温箱试验1d就出现坏包。经对管路仔细检查发现，由首台包装机通往后台包装机的输奶管路中，有一处接管焊接质量不好，凹凸不平，且有微小缝隙（不渗奶），用胶堵住后，产品合格。正是由于这个微小的缝隙，使外界的有菌空气随奶液的流动进入管道内，造成二次污染。
10) 操作技能差也是二次污染的重要原因。人机协调是半自动化生产的重要因素，专业知识的充分利用以及操作人员的技术智能的发挥将保证产品的稳定生产。操作者队无菌包装机的性能是否熟悉，操作是否规范、熟练，特别是对无菌环境的建立，是否无菌正压，包装机灭菌、包装膜灭菌是否彻底、双氧水浓度和温度是否达到要求，平时对包装机的维护是否充分，操作者的责任心等因素，都将影响到产品的二次污染。
奶管路引起污染的解决办法
灭菌机输出到包装机的灌装管路需采用306L或304全抛光不锈钢管，安装时应符合无菌管路的要求，尽量减少接头，控制阀应选用无菌型，整个管路不应有泄漏。如有条件应请专业设计单位设计安装。
包装机引起污染的解决办法
○1管路接头处胶垫不应有奶垢，更不能有泄漏；○2保持无菌室的门密封严密，并提供足够的正压力；○3保持上料泵机械密封完好无损，，选用合理型号的上料，彻底清洗；○4无菌室内与包装膜接触的构件保持清洁，不能有奶垢；○5彻底清洁灌装头和撑袋器，使不能有奶垢；○6注意清洁导膜辊。
无菌罐引起污染的解决办法
○1选用质量高的无菌罐，内表面抛光度符合生产要求，能保持良好密封性能，耐压性应达到蒸汽灭菌的要求；○2蒸汽灭菌后，UHT输出管路至包装机灌装管路应保持无菌状态（管路未密封），禁止有菌空气进入管路内；○3认真做好对包装机的日常维护，特别是横竖封应调到最佳工作状态，以避免封口质量不稳定，横封不能有褶，防止尖端有微渗等；○4包装前对各项参数予以检查，特别是双氧水浓度偏低将影响膜的杀菌效果；严格操作规程，保持无菌环境的良好和稳定。
